当山は、治承四（１１８０）年、源頼朝公の勅命により建立された“館”（廣澤の清浄殿＜ひろさわのしょうじょうでん＞）が発祥といわれている。

文永三（１２６６）年、宗尊親王の命により、源実朝公の御台所「久米御前」（法名「廣澤院従二位承山寶臺禅定尼」、千葉常胤公の娘）供養のため、清浄殿を「廣澤院　寶臺寺＜こうたくいん　ほうだいじ＞」と改めさせた。新編武蔵野風土記には「武藏野　現來　新坐郡　野方領　廣澤庄　久米留川里　片山之郷　大平山　廣澤院　寶臺寺」と記されている。

鎌倉時代、主要街道の整備が進み、また惣村の発達により、人の往来が盛んになると、当地に、他阿真教上人（時宗　第二祖）が遊行、逗留し、念仏道場を開いた。

時が過ぎ、江戸時代、武蔵国埼玉群由木に生まれた、由木左衛門尉利重公の二男「存応上人」が、十歳の時、母に連れられ、当山第１４世「蓮阿上人」の元で出家、得度する。存応上人は「慈昌」＜じしょう＞と号し、時宗宗学を体得、修行に励んでいった。後に、存応上人は、「大長寺」（鎌倉岩瀬）に移り、浄土宗鎮西流白旗派（現在の浄土宗）を修学するようになる。

修学に伴い、存応上人は「増上寺」「蓮馨寺」等の住寺として、念仏生活を続けた。ある時、徳川家康公と出会い、親交をもつようになる。家康公の菩提所は浄土宗「大樹寺」（三河）であるが、入府すると三河は遠いので、地元に菩提所を造る必要があり、増上寺が菩提所として選ばれた。

こうして、存応上人と家康公の結びつきが生まれ、また家康公は存応上人を寵愛するようになった。

家康公の宗教政策と相まって、存応上人は淨土宗内でもその存在を高めていった。存応上人は後陽成天皇に浄土の法門を進講し、国師号「普光観智国師」を賜った。普光観智国師存応上人は、これを大いに喜び、自ら六九歳の寿像を造らせ、当山に収めさせた。併せて、当山を浄土宗に改宗させ、寺号を「法臺寺」に改めた。

当山は、家康公より寺領十三石五斗の御朱印を賜り、増上寺の旧本堂を当山に移築、寺域を整えていった。

明治二十年、近隣の災禍を受け、当山は本堂以下の堂宇を悉く灰燼に帰した。明治二五年、五間四方の仮本堂を建立したが、激動の昭和期を経て老朽化激しく、第三十六世信翁和尚と先住により寺域伽藍の整備を発願、平成十年に落慶を迎え、今日に到る。